مالیات ارزش افزوده‌ی قرارداد پیمانکاری در تاریخ صدور صورت‌حساب تعلق می‌گیرد (ماده‌ی ۳ و تبصره‌ی ۲ ماده‌ی ۴ قانون مالیات بر ارزش افزوده)، نه در تاریخی که کار به درصد معینی می‌رسد و نه در تاریخ دریافت پول. آنچه به دریافت پول بسته است، زمان پرداخت مالیات است: اگر قرارداد و پرداخت‌ها در سامانه‌ی مؤدیان ثبت و تأیید شده باشند، پیمانکار مالیات هر صورت‌حساب را به نسبت مبلغی که از کارفرما دریافت می‌کند می‌پردازد.
مثال فرضی: سه صورت‌وضعیت
| صورت‌وضعیت | مبلغ صورت‌حساب | مالیات متعلق | دریافتی از کارفرما | مالیات پرداختنی در همان دوره |
|---|---|---|---|---|
| اول (پیشرفت ۳۰٪) | ۹۰۰ | ۹۰ | ۹۰۰ | ۹۰ |
| دوم (پیشرفت ۷۰٪) | ۱٬۲۰۰ | ۱۲۰ | ۶۰۰ | ۶۰ |
| سوم (پیشرفت ۱۰۰٪) | ۹۰۰ | ۹۰ | ۱٬۵۰۰ (شامل باقی‌مانده‌ی دوم) | ۱۵۰ |
| جمع | ۳٬۰۰۰ | ۳۰۰ |
اگر همین قرارداد در سامانه ثبت نشده باشد، معامله نقدی فرض می‌شود (تبصره‌ی ۱ ماده‌ی ۴) و مالیات هر صورت‌حساب در دوره‌ی صدور آن کامل پرداختنی است؛ در مثال بالا، ۱۲۰ میلیون در دوره‌ی دوم به جای ۶۰ میلیون.
خطاهای رایج
- درصد پیشرفت کار، تاریخ تعلق مالیات فرض می‌شود و صورت‌حساب تا تسویه‌ی کامل صادر نمی‌شود.
- قرارداد در سامانه ثبت نمی‌شود و پیمانکار مالیات دریافت‌نشده را یک‌جا می‌پردازد.
- کسورات حسن انجام کار یا پیش‌پرداخت از مبلغ صورت‌حساب کم می‌شود بدون آنکه اثرش بر مالیات روشن شود.
قاعده‌های کلی پیمانکاری در ارزش افزوده قراردادهای پیمانکاری و پروژه‌ای آمده است. ثبت صورت‌وضعیت‌ها و پرداخت‌ها در سامانه، کار خدمت راه‌اندازی و پشتیبانی سامانه مودیان ویراف است.
- ۱.قانون مالیات بر ارزش افزوده (مصوب ۱۴۰۰) — معاونت تدوین، تنقیح و انتشار قوانین و مقررات ریاست جمهوری (qavanin.ir)، ماده‌ی ۳؛ ماده‌ی ۴، تبصره‌های ۱ تا ۳تاریخ مراجعه: ۱۴۰۵/۰۷/۱۶